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MSYS2 のシェルでコマンドを実行するとパスが自動的に Windows のスタイルに変換される。この変換を抑止するためには、コマンドの頭に MSYS2_ARG_CONV_EXCL='*' と書く。 詳しくは:Filesystem Paths - MSYS2
MSYS2_ARG_CONV_EXCL='*'